Em 1999, Joutarou Kuujou chega à cidade japonesa de Morioh por dois motivos: para conhecer seu tio ilegítimo Jousuke Higashikata e investigar um usuário potencialmente perigoso do Stand. Poucos minutos depois de chegar, ele atinge seu primeiro objetivo; no entanto, Joutarou descobre que Jousuke não é apenas um estudante muito mais jovem do ensino médio, mas também possui seu próprio Stand chamado Crazy Diamond. Pouco tempo depois do encontro, os dois fazem uma descoberta surpreendente: alguém está usando um arco e flecha sobrenatural para criar usuários do Stand perto de Morioh.
Quando Jousuke testemunha a ameaça que isso representa, ele decide proteger sua cidade e impedir a propagação de usuários letais do Stand. Encontrando aliados e inimigos entre esses usuários, Jousuke aprende o quanto os interesses e ambições pessoais de alguém podem ser refletidos em suas posições e o dano ou virtude resultante que isso traz. À medida que continuam a investigar, eles começam a desenterrar a história chocante de Morioh, trazendo à tona perigos ocultos e um mistério de anos passados.