Quando uma luz misteriosa envolve repentinamente a Terra, a humanidade inteira é petrificada, ficando presa em estátuas de pedra. Milhares de anos depois, o mundo está tomado pela vegetação, e florestas ocuparam o lugar das cidades que antes se erguiam majestosas.
Um dos primeiros a emergir de sua prisão de pedra é Taiju Ooki, que descobre que seu grande amigo, o brilhante jovem cientista Senkuu, já vinha se preparando para esse momento. Enquanto Taiju deseja salvar a garota que ama, Senkuu está determinado a descobrir a causa do estranho fenômeno e restaurar o mundo à sua antiga glória.
No entanto, quando libertam o infamemente poderoso Tsukasa Shishiou para obter vantagem diante dos perigos desse mundo desconhecido, eles percebem que seu novo aliado tem outros planos. Tsukasa enxerga a situação como uma oportunidade para recomeçar do zero; livre da corrupção e da destruição causadas pela tecnologia, ele fará de tudo para alcançar seus objetivos.
Incapazes de chegar a um entendimento, Senkuu e sua devoção à ciência entrarão em conflito com Tsukasa e sua visão baseada na força e nos instintos primitivos, em uma disputa que realmente será uma batalha para atravessar eras.
