O implacável Ministro Honest explora a ignorância de um jovem e novo Imperador, governando o país nas sombras com uma moral distorcida e total desprezo pela vida humana. Como resultado, uma epidemia de crimes e corrupção se espalhou pela capital do país, criando uma sociedade na qual os privilegiados exercem domínio absoluto sobre os menos favorecidos.
No entanto, existe uma organização dedicada a combater esse abuso desenfreado de poder: a Night Raid, uma divisão secreta do Exército Revolucionário oposicionista. Ela é composta por uma pequena equipe de assassinos impiedosos que eliminam todos aqueles que participam ou fecham os olhos para as atrocidades cometidas pelo Império.
Tatsumi é um jovem ingênuo, habilidoso com a espada, que parte em uma jornada para salvar sua empobrecida vila. Em pouco tempo, ele testemunha em primeira mão os horrores sangrentos e a crueldade da capital. Consumido pelo ódio, Tatsumi é convencido pela nobre causa da Night Raid e decide se juntar ao grupo, embarcando em uma dolorosa e perigosa missão para se vingar do Ministro Honest.
Ao longo de sua jornada, Tatsumi adquire inúmeras experiências valiosas enquanto confronta os dilemas éticos de ideologias conflitantes, a vida e a morte, tudo isso enquanto luta para restaurar um mundo mais humano.